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🧬 PD CEN TS 16827 是英国标准学会(BSI)以欧洲技术规范 CEN/TS 16827 为依据发布的英国实施文件,针对分子体外诊断(IVD)中福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织的检测前处理规程。该系列由英国技术委员会 CH/212「体外诊断器械(IVDs)」参与制定,归口 ICS 11.100.10(体外诊断器械),为病理科与分子实验室在 FFPE 组织上开展 RNA、蛋白质与 DNA 分析提供了标准化的检测前(pre-examination)流程要求,是肿瘤分子病理、基因检测与精准医疗质量保证的重要支撑。
PD CEN TS 16827 系列由 3 个分部组成,分别针对 FFPE 组织中三类待测分子的提取物:RNA、蛋白质与 DNA。三分部共享检测前处理的一般考虑(General considerations)与术语定义,并针对不同分析物给出专门要求。
| 分部编号 | 发布年份 | 名称 | 核心内容 |
|---|---|---|---|
| PD CEN/TS 16827-1 | 2015 | 提取 RNA | 规定 FFPE 组织用于 RNA 分析时的检测前处理要求 |
| PD CEN/TS 16827-2 | 2015 | 提取蛋白质 | 规定 FFPE 组织用于蛋白质分析时的检测前处理要求 |
| PD CEN/TS 16827-3 | 2015 | 提取 DNA | 规定 FFPE 组织用于 DNA 分析时的检测前处理要求 |
系列在一般考虑部分明确了影响 FFPE 组织分子分析质量的共性因素,涵盖组织采集、固定、脱水、包埋、切片、贮存与核酸/蛋白提取等环节:
一般考虑部分还强调了质量控制与记录要求,确保每一份 FFPE 样本的检测前处理过程可追溯、可重复。
Part 1 规定 FFPE 组织用于提取 RNA 分析时的检测前处理要求。RNA 是最易降解的核酸,检测前处理需要特别关注核糖核酸酶(RNase)污染与固定条件对 RNA 完整性的影响。
| 关键环节 | 要求 |
|---|---|
| 固定与脱蜡 | 控制固定时间,规范脱蜡与水化步骤,降低 RNase 活性 |
| RNA 提取 | 采用标准化的提取方法,避免 RNA 降解与基因组 DNA 污染 |
| 完整性评估 | 通过 RIN 值或类似指标评估 RNA 完整性,作为后续检测的质量前提 |
| 应用场景 | 基因表达分析、转录组测序、融合基因检测等 |
Part 1 还涉及 RNA 逆转录与扩增前处理的要求,确保从 FFPE 组织中获得的 RNA 能够支持可靠的定量与定性分子检测。
Part 2 规定 FFPE 组织用于提取蛋白质分析(如免疫组织化学、蛋白组学、免疫印迹)时的检测前处理要求。福尔马林固定造成的蛋白质交联是主要挑战,需要适当的抗原修复与蛋白提取策略。
| 关键环节 | 要求 |
|---|---|
| 抗原修复 | 采用热诱导或酶消化等修复方法,恢复被交联遮蔽的表位 |
| 蛋白提取 | 标准化提取缓冲液与流程,保证蛋白得率与可溶性 |
| 定量与保存 | 对蛋白浓度进行定量,规范样本保存避免降解 |
| 应用场景 | 免疫组化、Western blot、质谱蛋白组学等 |
Part 3 规定 FFPE 组织用于提取 DNA 分析时的检测前处理要求。DNA 相对稳定,但固定与处理仍会造成交联与片段化,影响长片段 PCR 与测序质量。
| 关键环节 | 要求 |
|---|---|
| 固定与脱蜡 | 控制固定条件,规范脱蜡以释放高质量 DNA |
| DNA 提取 | 标准化提取方法,评估纯度与片段大小分布 |
| 降解与交联评估 | 通过 PCR 或定量评估 DNA 可扩增性,判断交联修复是否必要 |
| 应用场景 | 基因突变检测、甲基化分析、二代测序(NGS)等 |